21 Mart 2012 Öğrenci projesi Sunumu Molekuler Dinamik Simulasyona Giriş ve kullanılan programlar Microsoft Powerpoint 1997-2003( ppt)
Önemli not: 28 Mart 2012 tarihli derste, sizden istediğim grafikleri çizip bana getirmeniz veya yollamanız gerekmektedir. Bunun dışında programlanmış bir dersimiz şu anda yoktur.
Sonuçları bana getirmeniz için bir son tarih yok.
28 Mart 2012 Öğrenci projesi yardımcı olacak bilgiler:
------------Not: Assagidaki .png uzantılı dosyalar resim dir. Yazı değildir. Copy paste veya tıkalama yapamazsınız.---------------------
Bilgisyar simulasyonu ile ilgili bilgi bulunabilecek yerler anlatılıyor: Md-yardimcidosya-1.png Ben su adreside öneririm (bir başka web sayfasıdır) Democritus
Kısa giriş yapılmakta. Newton yasası ve potansiyel açıklanmaktadır. Md-yardimcidosya-2.png
Simulasyon 2 kısımdan oluşur: Dengeye getirme ve örnekleme. Bu kısımda bu başlıklar anlatılmaktadır. Md-yardimcidosya-3.png
Örnek bir krypton.in dosyası verilmektedir. Md-yardimcidosya-4.png
krypton.in dosyası satır satır açıklanmaktadır. Md-yardimcidosya-5.png
control.krypton dosyası verilmektedir. Md-yardimcidosya-6.png
control.krypton dosyası satır satır açıklanmaktadır. Md-yardimcidosya-7.png
Sizden yapmanızı istediğim ödev açıklanmaktadır : Step ile enerjinin korunması arasındaki grafiği çizip ( gnuplot programı ile) yollayın Md-yardimcidosya-8.png
Sıkça sorulan sorular kısım 1 Md-yardimcidosya-9.png
Sıkça sorulan sorular kısım 2 Md-yardimcidosya-10.png
Sıkça sorulan sorular kısım 3 Md-yardimcidosya-11.png
---------------------- Yardımcı Bilgiler bitti------------------------------------
Control ve in dosyaları text dosyalarıdır. Copy paste yapılabilir veya masaustunuze indirip kullanabilirsiniz
GNUPLOT grafik cizim programına ihtiyacınız olabilir. Temel anlatım için : Gnuplot Bunun dışında internette birçok web sayfasını sizde bulabilirsiniz
Geçmiş senelere ait Molekuler Dinamik Simulasyona Giriş ( pdf ) ( sxi - Open office presentation)
Önemli Not: Moldy moleküler dinamik simulasyon programıdır. Gnuplot ise verilen datalar için grafik çizen bir programdır. Birbirleri ile bir ilgisi yoktur.
